Вопрос не в том, системная это проблема или нет. Никто здесь не знает механику работы хрома (как и других перечисленных браузеров, которые теперь являются его клонами).  Единственное что могу сказать, есть настройки в групповой политике, в разделе 

Remote Desktop Services\Remote Desktop Session Host\Device and Resource Redirection

Limit audio playback quality и Audio Quality

Возможно, они как-то влияют.

И в .rdp файле есть похожая настройка  audioqualitymode

Обращаться в платную техподдержку с вопросом "искажается звук в Google Chrome" думаю не стоит. Нужно хотя бы выяснить какие-то детали, что Chrome использует для работы со звуком, и соответственно жаловаться  что такой-то компонент ОС некорректно работает при таком-то сценарии. Так или иначе, без участия людей, понимающих что-то в Google Chrome, проблему не решить.