.NET Framework 4.6 в Windows 10 является встроенным компонентом ОС. Ее нельзя удалить штатными средствами. В более старых версиях ОС ее можно удалить, сняв галку в окне "Программы и компоненты - Включение или отключение компонентов Windows".

Однако, очень маловероятно, что какие-то программы не запускаются из-за самого факта наличия .NET 4.6, и что его удаление что-то даст. Скорее наоборот, у вас отвалиться больше программ. Опишите проблему подробнее, какие программы не запускаются и что именно пишут в ошибке.

Можно:

https://www.microsoft.com/ru-ru/download/details.aspx?id=17718

https://www.microsoft.com/ru-RU/download/details.aspx?id=53344

.NET Framework 4.0 вы не сможете установить на Windows 10, так как эта версия более старая, чем встроенная в Windows 10.